鱼油的保健功效主要来自能够降血脂、健脑的EPA和DHA，因为它们很不稳定，在空气中易氧化变质，故鱼油一般都被放在胶囊中。在美国，鱼油卖得好，是因为吃鱼油比吃鱼方便、便宜，且不必担心鱼是否被污染(有污染的重金属主要在鱼肉中)。
事实上，吃鱼对人体的健康作用比吃鱼油更好，除了鱼油外，鱼还含有丰富的优质蛋白、维生素和矿物质。有研究显示，鱼中所含的毫克DHA的功效和鱼油中毫克相当，这可能是因为鱼中的DHA与其他营养成分发生协同作用而增强效果。在我国，鱼油并不便宜，所以直接吃鱼更好。可选择“肥”点的鱼，如沙丁鱼、鲤鱼、鲶鱼、比目鱼、青鱼、鳟鱼、金枪鱼、三文鱼等，相对含鱼油更多。