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利用全基因组数据进行鲶鱼抗菌肽的鉴定增强 [复制链接]

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斑点叉尾鮰抗菌肽的多样性

摘要抗菌肽,又称宿主防御多肽,是生物为了应对病原体感染而演化出的原始防御性武器。鱼类抗菌肽具有杀菌特性,它可以被病原体和非生物应激等多种因素诱导产生从而参与宿主免疫应答反应。这些诱导因素可通过激活下游信号通路,来启动抗菌肽基因的表达。由于许多水生动物已经完成了大规模的基因组测序,这为系统鉴定这些物种的抗菌肽提供了数据库。最近,斑点叉尾鮰(Ictaluruspunctatus)的全基因组和蛋白质组已经公布,我们通过将抗菌肽数据库与蛋白质组相结合,建立了一个鉴定斑点叉尾鮰抗菌肽的生物信息学分析方法。本综述介绍了一种基于蛋白质数据库的鉴定和开发未知抗菌肽的有效方法,并总结了斑点叉尾鮰的抗菌肽的结构特性、免疫调节和体内分子应答。此外,本文还进行了人工合成抗菌肽与离体细胞抗菌肽的抗菌活性评估,并介绍了基因工程和CRISPR/Cas9技术在鱼类抗菌肽中的应用,从而为抗菌研究和水产养殖中的疾病治疗提供支撑。本文对于不同种类抗菌肽的总结和比较,增强了我们对抗菌肽本身及其跨物种应用的认识,并且使利用基因工程和基因组编辑技术的方法来增强动物免疫成为可能,最终有助于保护水产经济动物免受病原菌的感染。关键词

抗菌肽,APD3,鱼类,基因组编辑,转基因,免疫

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Abstract

Antimicrobialpeptides(AMPs),alsoknownashostdefencepeptides,areevolutionarilyancientdefensiveweaponsthatcan
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